RNA聚合酶是細(xì)胞里的“CPU”,它們能“讀取”細(xì)胞的“硬盤”DNA,隨后輸出各種生命操作。在復(fù)雜的生物細(xì)胞里,一共有9種類型“CPU”(細(xì)菌細(xì)胞CPU、古菌細(xì)胞CPU、真核生物細(xì)胞核的5類CPU、葉綠體CPU、線粒體CPU),其他類型“CPU”的構(gòu)造相繼被破解,只剩葉綠體“CPU”之謎未解。中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心張余研究團隊和華中農(nóng)業(yè)大學(xué)周菲研究團隊合作,將最后一塊、也是最難的拼圖補上。
上海科學(xué)家領(lǐng)銜的團隊解析了葉綠體基因轉(zhuǎn)錄機器的冷凍電鏡結(jié)構(gòu),揭示了葉綠體基因轉(zhuǎn)錄機器的“裝配部件”“裝配模式”和“功能模塊”。這一成果于北京時間今天(1日)凌晨登上了國際頂尖學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》(Cell)的封面。
眾所周知,光合作用是地球上最偉大的反應(yīng)之一。葉綠體則是植物光合作用的場所,也是植物特有的細(xì)胞器。葉綠體的光合作用將光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能,為地球上生命提供了能量和氧氣。
張余研究員介紹,大約15億年前,原始的真核細(xì)胞吞噬了藍(lán)細(xì)菌,進化出真核單細(xì)胞藻,隨后再進化出高等植物。在進化過程中,大部分藍(lán)細(xì)菌的基因丟失或者轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核,形成了小而精的葉綠體基因組。
“葉綠體基因組保留了基因轉(zhuǎn)錄、蛋白翻譯和光合系統(tǒng)相關(guān)蛋白編碼基因。”張余告訴記者,“不過,葉綠體基因轉(zhuǎn)錄機器的構(gòu)造依然未知?!卑四昵皬堄嗌暾埣尤敕肿又参镒吭街行臅r,就將破解“光合能量的轉(zhuǎn)換與調(diào)控機制”這道難題設(shè)為目標(biāo)。
研究團隊注意到,轉(zhuǎn)錄葉綠體基因組的機器一點兒都不簡單——其“身形”變?yōu)樵瓉淼?.5倍,其“裝配部件”數(shù)量變?yōu)樵瓉淼?倍。這回,科學(xué)家們選擇的模式植物可謂既熟悉又陌生:煙草。張余解釋,這種俗稱“大煙草”的模式植物個頭大,生物量大,葉綠體基因編輯的遺傳轉(zhuǎn)化技術(shù)更為成熟。
記者獲悉,研究團隊首先利用葉綠體轉(zhuǎn)化技術(shù)構(gòu)建了葉綠體轉(zhuǎn)基因煙草,隨后通過親和純化的方式獲得完整的葉綠體基因轉(zhuǎn)錄蛋白質(zhì)復(fù)合物,最終利用單顆粒冷凍電鏡技術(shù)成功解析了葉綠體基因轉(zhuǎn)錄機器構(gòu)造。
“生命太奇妙了!如果讓人去設(shè)計,一定設(shè)計不出來?!睆堄噘潎@。與原核藍(lán)細(xì)菌基因轉(zhuǎn)錄機器相比,葉綠體基因轉(zhuǎn)錄機器一共具有20個“裝配部件”(蛋白亞基),組成了5個功能模塊——催化模塊、支架模塊、保護模塊、RNA模塊和調(diào)控模塊。
“催化模塊由葉綠體基因組編碼,其蛋白亞基起源于藍(lán)細(xì)菌;其他模塊由細(xì)胞核基因組編碼,其大部分蛋白亞基起源于真核細(xì)胞,在細(xì)胞質(zhì)翻譯后運輸至葉綠體完成組裝?!睆堄嘟榻B,這些原核和真核起源的蛋白亞基組成了目前已知最復(fù)雜的基因轉(zhuǎn)錄機器。
他繼續(xù)娓娓道來,藍(lán)細(xì)菌來源的催化模塊包含6個蛋白亞基,其位于復(fù)合物的核心層;支架模塊包含7個蛋白亞基,它們一方面穩(wěn)定催化模塊,另一方面提供其他模塊的結(jié)合位點;RNA模塊包括1個亞基,能夠序列特異性結(jié)合RNA,推測可能參與轉(zhuǎn)錄關(guān)聯(lián)的RNA加工過程;調(diào)控模塊包括4個亞基,推測它們參與基因轉(zhuǎn)錄機器的活性調(diào)控。保護模塊包括2個亞基,它們具有超氧化物歧化酶的功能,使其免受葉綠體中超氧化物的氧化攻擊。
“超氧化物歧化酶的英文縮寫是SOD,相信大家以前都聽到過相關(guān)的廣告詞。SOD酶能夠?qū)⒒钚猿蹶庪x子通過反應(yīng)轉(zhuǎn)化為沒有太多活性的過氧化氫?!睆堄嘌a充道,“這幾天是陰天,可在夏季正午時候,日光強烈,此時葉綠體光合作用會產(chǎn)生較多超氧陰離子。有時會影響葉綠體基質(zhì),損傷生物大分子。而SOD酶能清除葉綠體基質(zhì)里的超氧陰離子,幫助適應(yīng)環(huán)境?!?/p>
研究團隊表示,這項成果在基礎(chǔ)研究層面,為進一步探索葉綠體基因轉(zhuǎn)錄的工作模式,理解葉綠體的基因表達(dá)調(diào)控方式打下了基礎(chǔ);而在應(yīng)用層面,研究為改造葉綠體基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò),增加光合作用復(fù)合物的基因表達(dá),提高光合作用效率打下了基礎(chǔ)。
“提高光合作用復(fù)合物基因表達(dá),可以增加作物的生物量,提高作物產(chǎn)量?!睆堄嘟忉?,此外,提高植物的光合作用,理論上可以提高植物固定二氧化碳的能力,增加植物碳匯。
分子植物卓越中心主任、中國科學(xué)院院士韓斌表示,光合作用的研究曾獲得諾貝爾獎的青睞,解析葉綠體機制和功能是中心的重要突破方向,“最難啃的骨頭也最有意義”。期待未來輔以冷凍電鏡的“利劍”,助力科研人員沖刺科學(xué)制高點。